至元十六年(1279) 元
设元谋县。
至元二十九年(1292)
元朝政府于驻防和曲州(辖武定、元谋)的爨(彝族)、夔(傣族)军内,挑出187人,在当地屯田,耕种土地3740亩。
明
洪武十五年(1382)
世袭土知县阿吾降明,与流官张元礼合治元谋。
正德十年(1515)
五月,地震,官署、民房倾倒殆尽。
隆庆三年(1569)
改土设流,罗士英任元谋知县,按实况制订规章制度,上下相安。
万历四年(1576)
元谋知县张维,暴虐异常,经刑部给事中严用和弹劾,帝令“按臣勒限提问”。
万历三十一年(1603)
赵某(名、籍不详)代理知县,遵照前任于文蔚与当地士绅的决议,筑县城(老城)。设保甲,定盐课。
万历三十六年(1608)
武定阿克、郑举叛,陷元谋县城。元谋知县毛文彩以失守县城,“下狱论死”。同年,世袭土司吾孟才率300人配合官兵收复县城。
天启二年(1622)
知县齐以政改筑砖城。
崇祯三年(1630)
知县范齐欧呈请建学置官。
南明隆武元年(1645)
嘉国公遣参将李大贽屯兵会川(会理),防大西军白蜀入滇。会川与元谋相邻。大贽贪婪,数扰诸夷(一说数侵必奎),必奎不能堪,隧反“,于八月底占领县城;九月九日,遣兵头高科、吾凌霄陷武定,“府城内外,毁劫一空”;吾必奎率主力西进,似如破竹,“始而大姚失守,再而定远被陷,遂至姚安沦没,将及威楚(楚雄)矣”!南明云南政府急派省城驻军、沐府亲兵和石屏土司龙在田等五土司兵会集威楚,与吾必奎决战。九月下旬,吾必奎部以寡不敌众被击溃,吾必奎被擒(一说逃往会川后自杀)。在镇压叛乱中,当地土豪张毓秀曾为明军向导。吾必奎死,其党羽欲杀张毓秀为之报仇。“秀遂召集亡命,拥众仇杀者数年”。“此地蹂躏被祸甚烈,村庄百姓,杀掳殆尽”。此后数年“兵燹荒凉,瘴毒尤甚,所委邑宰,无肯至者”。
永历八年(1654)
“邑人共推(安)王图权行县事。时土匪四起,王图招集流亡,开垦荒芜,捍御寇盗,民赖以安”。